Les écoles doctorales qui peuvent être reliées aux problématiques environnementales et proposer des candidatures de doctorat à l'ITE sont les suivantes (liste non exhaustive).

• Sciences de l'environnement d'Ile-de-France (ED 129)
• Sciences de la nature et de l'homme : évolution et écologie (ED 227)
• Chimie physique et chimie analytique de Paris Centre (ED 388)
• Pierre Louis de santé publique à Paris : épidémiologie et sciences de l'information biomédicale (ED 393)
• Physique et chimie des matériaux (ED 397) • Géosciences, ressources naturelles et environnement (ED 398)
• Chimie moléculaire de Paris centre (ED 406)
• Géographie de Paris (ED 434)
• Complexité du vivant (ED 515 )
• Sciences de la terre, de l'environnement et physique de l'univers (ED 560)
• Physique en Ile-de-France (ED 564)